Ο βιολογικός καθαρισμός είναι βαθύς και ποιοτικός καθαρισμός με στόχο την ουσιαστική απολύμανση και καθαριότητα του εσωτερικού του αυτοκινήτου μας. Για την απομάκρυνση των μικροβίων και καταλοίπων από όλα τα σημεία του αυτοκινήτου, χρησιμοποιούνται ειδικά μηχανήματα ψεκασμού – τριβής και ταυτόχρονης αναρρόφησης υγρών – στερεών. Πολλές εταιρείες προβαίνουν στην αφαίρεση των καθισμάτων κατά τη διάρκειά του, κάτι που πρέπει να προτιμάται εάν το κόστος το επιτρέπει. Γίνεται αποκλειστικά με χρήση οικολογικών, υποαλλεργικών προϊόντων με ουδέτερο Ph και χωρίς λευκαντικά, ώστε να είναι φιλικά τόσο στους επιβάτες όσο και στις επιφάνειες που καθαρίζονται. Το αποτέλεσμα πέραν της καθαριότητας είναι και η αποφυγή οσμών που κάνουν την παραμονή στο αυτοκίνητο επικίνδυνη πέρα από δυσάρεστη.
Ο βιολογικός καθαρισμός προτείνεται να γίνεται τουλάχιστον μια φορά το χρόνο, ειδικά για την απολύμανση του συστήματος εξαερισμού για την διασφάλιση της υγείας του αναπνευστικού συστήματος των επιβατών.